Quienes se oponen al acontecimiento guadalupano lo hacen por una de las siguientes razones:

1. "Guadalupe" sería un mito religioso que representaría las antiguas tradiciones religiosas mexicanas sincretísticamente asumidas por el catolicismo. La Virgen de Guadalupe sería la transposición católica de una "divinidad" pagana, como Tonantzin, la diosa madre benévola, y Juan Diego uno de los personajes del mito .
   
   
2. "Guadalupe" sería un instrumento catequético usado por los misioneros en la evangelización de los indígenas; habrían aplicado al caso mexicano la tradición española que usaba el teatro, las escenificaciones y los pasos procesionales con tal fin dando lugar a una rica tradición escultórica e iconográfica. En esta línea se sitúa el ex-abad de la Basílica de Guadalupe, Guillermo Schullemburg: se trata de una simple devoción mariana, apoyada en el símbolo de una imagen.
   
   
3. "Guadalupe" sería fruto del naciente criollismo a partir del siglo XVII, una afirmación de poder frente a los peninsulares españoles. Habría nacido así el nacionalismo mexicano con raíces criollas y la Virgen de Guadalupe sería su símbolo. Solamente en un segundo tiempo se daría espacio al indio Juan Diego y alos indios, que no habrían sido recordados como protagonistas en el hecho hasta entrado el siglo XVIII. La misma Independencia mexicana habría sido proclamada bajo este símbolo .
   
   
4. Para otros, la duda nacería de la falta de fuentes exhaustivas en los primeros veinte años; pesa mucho sobre ellos el llamado "silencio documental franciscano", especialmente el de fray Juan de Zumárraga, primer obispo de la diócesis de México, y el de otros cronistas de la época, sumamente fieles en la transmisión de los hechos más importantes de la conquista y de la evangelización .
   
   
5. Otros, temen que haya demasiadas publicaciones o formas devocionales guadalupanas en las que prevalecería lo devocional, sin preocuparse de lo histórico, con el riesgo de caer en el fideismo o en el sentimentalismo